Zhromažďovanie, spracúvanie a uchovávavanie biologických vzoriek musí byť systematické a v súlade s medzinárodnými štandardami. Na Jesseniovej lekárskej fakulte Univerzity Komenského v Martine pôsobí Biobanka pre nádorové a zriedkavé ochorenia. Je špecializovaným vedecko-výskumným pracoviskom s depozitármi, ktoré majú vysokú kapacitu uskladnenia vzoriek a sú jedinečné nielen na Slovensku, ale aj v blízkom okolí.

Slovensko sa v roku 2025 stalo členom európskej výskumnej infraštruktúry pre biobankovanie BBMRI-ERIC, k čomu prispelo najmä aktívne angažovanie Biobanky pre nádorové a zriedkavé ochorenia v Martine. Tá sa následne stala aj koordinátorom národného uzla a lídrom združenia BBMRI.sk. Členmi združenia BBMRI.sk sú aktuálne okrem Jesseniovej lekárskej fakulty (JLF) UK aj ďalšie subjekty, ktoré prevádzkujú vlastné biobanky – Lekárska fakulta UK v Bratislave, Národný onkologický ústav v Bratislave, Fakultná nemocnica s poliklinikou F. D. Roosevelta v Banskej Bystrici, Biomedicínske centrum Slovenskej akadémie vied, Neuroimunologický ústav SAV a Univerzitná nemocnica L. Pasteura v Košiciach.

„Unikátny je predovšetkým plne automatizovaný depozitár Quadbank, ktorý má kapacitu na uskladnenie až 3,4 milióna vzoriek (3,4 milióna kryoskúmaviek s objemom 600 mikrolitrov a 1,7 milióna kryoskúmaviek s objemom 1 000 mikrolitrov). Uskladnenie je možné aj v kryodepozitároch umožňujúcich skladovanie v tekutom dusíku pri teplote −190 °C, ako aj v depozitári pre patologické FFPE (formalínom fixované, parafínom zaliate) bločky a histologické sklíčka pri teplote 21 °C. Kapacita tohto depozitára je 700 tisíc FFPE bločkov a 1,3 milióna histologických sklíčok,“ uviedla pre ozdravme koordinátorka BBMRI.sk pre etické, právne a spoločenské otázky (ELSI) Ľubica Kotorová Slušná.

Prísna ochrana údajov

Medzi hlavné funkcie biobanky patrí zber, príjem, spracovanie, uchovávanie a odborná správa biologických vzoriek v súlade s definovanými štandardmi kvality a bezpečnosti. Súčasťou je aj zabezpečenie vhodných podmienok na dlhodobé uchovávanie vzoriek tak, aby bola zachovaná ich kvalita a integrita pre súčasné aj budúce výskumné využitie. Prevádzka depozitárov je postavená na nepretržitom monitorovaní a viacstupňových záložných opatreniach tak, aby ani pri výpadku elektrickej energie nebola ohrozená kvalita a bezpečnosť uchovávaných vzoriek. Biobanka aktuálne prijíma, spracováva a uchováva najmä krv, sliny, moč, stolicu a tkanivá. Výskumníkom sprístupňuje vzorky, nemajú však prístup k identifikačným údajom darcov.

{{gift}}

Biologické vzorky od darcov prijíma výhradne na základe ich informovaného súhlasu s využitím na výskumné účely. Vzorky sú označené jedinečnými kódmi, ktoré umožňujú oddelenie biologických vzoriek od identifikačných údajov darcov a v biobanke sú vedené v pseudonymizovanej (kódovanej) forme. „Identifikačné údaje sú vždy uchovávané oddelene od vzoriek a prístup k nim je možný iba za splnenia presne stanovených podmienok a v súlade s platnými právnymi a etickými požiadavkami,“ vysvetlila Kotorová.

Dôležitou funkciou biobanky je podľa nej tiež správa a odborná evidencia údajov súvisiacich so vzorkami. „V závislosti od konkrétneho výskumného projektu môže ísť o klinické, fenotypové, epidemiologické, genetické, omické a ďalšie relevantné údaje. Ich správne prepojenie so vzorkami významne zvyšuje ich vedeckú hodnotu a umožňuje ich efektívne využitie v biomedicínskom výskume,“ vysvetlila.

{{suvisiace}}

Vzorky sú označované čiarovými kódmi a evidované v systéme, ktorý umožňuje sledovať ich typ, pôvod, spracovanie, uloženie, väzbu na konkrétny projekt, relevantné metadáta a prístupové práva. Podľa Kotorovej v biobanke kladú dôraz na ochranu osobných údajov, zachovanie dôvernosti a dodržiavanie etických princípov, aby vzorky a údaje využívali zodpovedne v prospech vedeckého poznania a rozvoja modernej medicíny. „Biobanka zároveň zabezpečuje kontrolovaný a bezpečný prístup k vzorkám a súvisiacim údajom pre schválené vedecko-výskumné projekty. Každý výdaj vzoriek a údajov z biobanky podlieha schváleniu Etickou komisiou. Schválenie Etickou komisiou musia mať zároveň aj samotné výskumné projekty, na ktoré sú vzorky poskytované,“ uviedla.

Výhody pre pacienta aj celú populáciu

Biobanka pre nádorové a zriedkavé ochorenia JLF UK nedávno iniciovala a podpísala zmluvu o spolupráci s Univerzitnou nemocnicou Martin, ktorá významne posilní biomedicínsky a klinický výskum na Slovensku. Pre pacientov to znamená rýchlejšiu diagnostiku, presnejšiu liečbu a vývoj nových liečiv.

„Táto zmluva prirodzene nadväzuje na dlhoročnú spoluprácu Jesseniovej lekárskej fakulty UK a Univerzitnej nemocnice Martin a posúva ju na novú úroveň. Posilňuje prepojenie špičkovej klinickej starostlivosti s výskumom a vzdelávaním, čo je nevyhnutným predpokladom rozvoja modernej medicíny. Verím, že toto partnerstvo prinesie nové možnosti pre vedcov, zdravotníkov aj študentov, avšak jeho najväčším prínosom bude benefit pre pacienta,“ povedala dekanka JLF UK profesorka Andrea Čalkovská.

„Biobankovanie predstavuje dôležitý základ pre akýkoľvek klinický výskum. Ak máme kvalitné vzorky, máme kvalitné výsledky výskumu, a tým vieme urýchliť poznanie rôznych ochorení, priniesť nové možnosti diagnostiky, terapiu prispôsobenú konkrétnym potrebám pacienta či nové liečivá. To v konečnom dôsledku prináša obrovský benefit pre celú populáciu,“ vysvetlil riaditeľ Univerzitnej nemocnice Martin, Ján Mikler.

„Biobanka nie je len archív biologického materiálu. Predstavuje výskumnú infraštruktúru, ktorá umožňuje bezpečne a štandardizovane uchovávať vzorky tak, aby boli pripravené na budúce vedecké projekty. Vďaka spolupráci s Univerzitnou nemocnicou Martin dokážeme prepojiť špičkovú klinickú starostlivosť s moderným biomedicínskym výskumom,“ dodala riaditeľka Biobanky pre nádorové a zriedkavé ochorenia Zuzana Danková.

Podmienky pri transporte vzoriek

Spolupráca biobanky s Univerzitnou nemocnicou Martin (UNM) bude zameraná najmä na zber, spracovanie a dlhodobé uchovávanie biologických vzoriek a súvisiacich údajov pre vedecko-výskumné účely

V praxi to bude fungovať tak, že pracovisko nemocnice, napríklad Ústav klinickej imunológie a lekárskej genetiky, bude v rámci konkrétneho vedecko-výskumného projektu potrebovať určitý počet biologických vzoriek a súvisiacich údajov. Pracovisko zabezpečí odber vzoriek, poučenie pacienta a získanie jeho informovaného súhlasu. Biobanku vopred informuje o plánovanom odbere, type a počte vzoriek a mieste a čase ich vyzdvihnutia. „Transport vzoriek z UNM do Biobanky zabezpečí Biobanka v špeciálnych transportných boxoch vybavených dátovými záznamníkmi, ktoré monitorujú teplotu počas prepravy a zaznamenávajú čas vyzdvihnutia a prijatia vzoriek. Po prijatí Biobanka zabezpečí ich spracovanie a dlhodobé uchovávanie za kontrolovaných podmienok. Takto pripravené vzorky zostanú v Biobanke uložené pre potreby konkrétneho výskumného projektu,“ objasnila Ľubica Kotorová Slušná.

Spolupráca však nebude obmedzená iba na vzorky určené pre konkrétny výskumný projekt, ale UNM môže poskytovať aj vzorky na možné budúce využitie v ďalších projektoch. Ich využitie bude vždy podliehať príslušným etickým pravidlám. „Pri prezentácii alebo publikovaní výsledkov výskumu nebude zverejnená totožnosť pacientov ani údaje, ktoré by mohli viesť k ich identifikácii,“ opäť zdôraznila Kotorová.

Kapacita a technologické vybavenie biobanky v Martine ju predurčujú k tomu, aby pôsobila ako Národná biobanka poskytujúca priestor pre uskladnenie vzoriek pre výskumníkov z celého Slovenska. Okrem toho poskytuje odborné konzultácie v oblasti biobankovania a metodickú podporu.

Od rokov čakania k dňom

Význam biobankovania na Slovensku spočíva najmä v tom, že sa zbiera veľké množstvo vzoriek, ktoré sú kvalitne uchovávané a v budúcnosti sa môžu využiť na rýchle testovanie diagnostických metód. Bez takto vytvorenej zbierky bolo doteraz potrebné čakať na zhromaždenie dostatočného počtu vzoriek od pacientov, aj keď už bola nová diagnostická metóda pripravená na testovanie.
„Pri systémovom biobankovaní máme potrebné vzorky k dispozícii v priebehu niekoľkých dní. To akceleruje rozvoj kvalitného klinického a translačného výskumu, z ktorého bude profitovať vedecká komunita, ale najmä pacienti,“ zdôraznil riaditeľ UNM Ján Mikler.

Spolupráca otvára klinickým pracoviskám UNM nové možnosti pri budovaní vlastných kolekcií vzoriek a realizácii výskumných projektov. Vďaka tomu, že Biobanka JLF UK koordinuje národnú výskumnú infraštruktúru BBMRI.sk, ktorá prepája biobanky na Slovensku s európskou sieťou, spolupráca získava medzinárodný rozmer.

Cieľom združenia BBMRI.sk je koordinovať aktivity v oblasti biobankovania na národnej úrovni a zastupovať Slovensko v medzinárodnej výskumnej infraštruktúre BBMRI-ERIC. Súčasťou jeho činnosti je podpora členov v oblasti biobankovania, šírenie odborných poznatkov a príkladov dobrej praxe, ako aj zabezpečenie prístupu k biologickým vzorkám a súvisiacim údajom. Združenie zároveň podporuje poskytovanie služieb v oblasti kvality, vzdelávania, ELSI problematiky, teda etických, právnych a spoločenských aspektov, a rozvoj digitálnych nástrojov pre biobankovanie. V Národnej biobanke v Martine pracuje 11 zamestnancov, ktorí zabezpečujú tak priamu prevádzku biobanky, ako aj chod národnej kancelárie BBMRI.sk.

„Členstvo Slovenska v BBMRI-ERIC významne zvyšuje viditeľnosť a dostupnosť slovenských biobankových zdrojov v medzinárodnom priestore,“ povedala ELSI koordinátorka Kotorová. Informácie o dostupných vzorkách a súvisiacich údajoch jednotlivých biobánk zapojených do siete sú sprístupňované prostredníctvom spoločného katalógu Directory, vďaka čomu ich môžu identifikovať a o ich využitie požiadať výskumníci z rôznych krajín sveta. Slovenské biobanky sa tak stávajú súčasťou európskej výskumnej infraštruktúry a ich biologické materiály môžu prispievať k medzinárodným vedeckým projektom a rozvoju modernej medicíny.

Biobanka je v prevádzke od roku 2023 a v súčasnosti sa nachádza vo fáze optimalizácie procesov, budovania kolekcií vzoriek, prípravy dokumentácie v oblasti kvality a budovania nových spoluprác. Chce sa uchádzať sa o BBMRI-ERIC Quality Label, teda európske označenie kvality pre biobanky, a následne dosiahnuť akreditáciu podľa medzinárodnej normy ISO 20387, ktorá predstavuje významný medzinárodne uznávaný štandard kvality a kompetentnosti biobánk.

Biobanka spolupracuje aj s Martinským centrom pre biomedicínu - BioMed Martin, ktoré disponuje odborným zázemím a moderným laboratórnym vybavením potrebným pre realizáciu špičkového biomedicínskeho výskumu. Tieto spolupráce podľa Kotorovej vytvárajú ekosystém pre kvalitný a inovatívny výskum, klinické testovanie a implementáciu nových metód personalizovanej diagnostiky a terapie.

Široký záber a nezastaviteľný vývoj

Biobanka nedávno tiež podpísala Memorandum o spolupráci s Asociáciou na ochranu práv pacientov, aby zapájali pacientov do rozvoja biobankovania a podporovali otvorený dialóg medzi odbornou a laickou verejnosťou.

V súčasnosti biobanka intenzívne zbiera vzorky v rámci viacerých lokálnych aj národných iniciatív. „Zároveň evidujeme požiadavky na vzorky pre rôzne výskumné projekty, ktorým sa snažíme priebežne vyhovieť. Náš záber je široký – nezameriavame sa výhradne na onkologické či raritné diagnózy, ale postupne budujeme kolekcie naprieč celým spektrom ochorení, čo nám umožňuje aj vysoká kapacita, ktorou disponujeme ako Národná biobanka,“ tvrdí Kotorová.

Biobankovanie sa vo svete systematicky rozvíja už dlhé roky a dnes predstavuje neoddeliteľnú súčasť modernej biomedicíny a kvalitného výskumu v rôznych oblastiach medicíny a biológie. Využívanie štandardizovaných a kvalitne spracovaných biologických vzoriek z biobánk sa stalo etablovaným štandardom. Slovensko preto nemôže zostať bokom a musí sa tomuto medzinárodnému vývoju aktívne prispôsobovať, podporovať rozvoj vlastnej biobankovej infraštruktúry a vytvárať podmienky na to, aby slovenský biomedicínsky výskum dokázal držať krok s vyspelými krajinami.

{{odporucane}}

Zázemie vytvára fakulta, ale peniaze si musia zháňať z rôznych zdrojov

Biobanka pre nádorové a zriedkavé ochorenia v Martine vznikla v rámci projektu Bioford, financovaného zo zdrojov európskych štrukturálnych a investičných fondov. Počiatočná investíciou z eurofondov bola vo výške takmer 17,9 milióna eur. Zástupcovia biobanky nešpecifikovali, koľko stojí jej samotná prevádzka, avšak podľa medializovaných informácií si vyžaduje približne 1,8 milióna eur ročne. Dlhodobo čelí otázkam a neistote ohľadom stabilného štátneho krytia. Pôvodné odhady nákladov boli pomerne vysoké, čo vyplýva z charakteru národnej biobanky – spravuje obrovské depozitáre, ktoré vyžadujú nepretržitú a energeticky náročnú prevádzku. Aktuálne pokračuje druhá fáza projektu Bioford a financovanie prevádzky biobanky  je viaczdrojové – z projektov, dotácií a spoluprác.

„Aktuálne sa preto zameriavame na neustálu optimalizáciu procesov a znižovanie prevádzkových nákladov. Sme súčasťou strategickej výskumnej infraštruktúry a zároveň plníme úlohu kancelárie národnej platformy (uzla BBMRI.sk). Významnú podporu nám poskytuje naša materská inštitúcia – Jesseniova lekárska fakulta UK, ktorá nám vytvára potrebné stabilné zázemie,“ hovorí Kotorová.

„Ďalšie prostriedky získavame prostredníctvom aktívnej účasti na vedecko-výskumných projektoch a do budúcnosti sa počíta aj s financovaním cez model úhrady nákladov (cost-recovery model) za služby spojené so zberom, spracovaním a uchovávaním vzoriek,“ doplnila koordinátorka.

Biobanka priamo nevykonáva žiadne vyšetrenia hradené zdravotnými poisťovňami. Okrem samotnej správy vzoriek však funguje aj ako národná kancelária BBMRI.sk, s čím sú spojené špecifické personálne výdavky na odborníkov zabezpečujúcich koordináciu, rozvoj, IT, legislatívu a kvalitu na celonárodnej úrovni. „Každá nová aktivita či rozšírenie výskumu prináša prínos pre celú komunitu, no zároveň si vyžaduje navýšenie zdrojov. V rámci štruktúry nákladov teda najvyššie položky predstavujú mzdy, služby, energie,“ spresnila Kotorová Slušná.

Nadväzovanie spoluprác, vrátane tých medzinárodných, podľa nej zohráva kľúčovú úlohu vo financovaní a dlhodobej udržateľnosti. Umožňuje zapájať sa do prestížnych európskych a medzinárodných výskumných konzorcií a čerpať grantové zdroje, ktoré by samostatná inštitúcia nemala možnosť získať. „Zároveň ako národná kancelária a biobanka staviame na partnerstvách s výskumnými ústavmi, nemocnicami a pacientskymi organizáciami. Medzinárodná akceptácia zvyšuje náš kredit u financujúcich orgánov a buduje dôveru verejnosti, čo je základným predpokladom pre zber kvalitných kolekcií vzoriek a ich efektívne využitie vo vede,“ uzavrela ELSI koordinátorka.

Prečo darovať biologický materiál?

Systematickým a kontinuálnym zberom biologického materiálu získava biobanka vysokokvalitné a početné súbory vzoriek, ktoré sa môžu veľmi flexibilne využiť na biomedicínsky výskum. Vedci a lekári tak nemusia roky zbierať vzorky na získanie súboru vhodnej veľkosti. Rovnako aj v prípade nových technológii, či liečiv sa môžu vedecké štúdie ihneď realizovať, čím sa zrýchlia výskumné procesy a získanie poznatkov. Informácie prispievajú k podrobnejšiemu poznaniu príčin a patofyziológie ochorení, ako aj k vývoju a validácií nových diagnostických metód a modernej terapie.

Výsledky výskumu sa využívajú aj v personalizovanej medicíne, pri ktorej je terapia individuálne prispôsobená každému pacientovi. Keďže pacienti môžu reagovať na štandardnú onkologickú liečbu odlišne, je dôležité nájsť najefektívnejšiu terapiu pre každého jednotlivca. To si vyžaduje podrobný a precízny výskum, pri ktorom sa údaje mnohokrát získavajú z medicínskych a biologických databáz.